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1999年
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1?月?13?日?中国科学院教育局批准生物物理所为中国科学院第一批接受外国留学生的单位。
1?月?21?日?王志新任生物物理所所长(第六届)。
6?月?王海龙任中共生物物理所党委副书记(主持工作，第六届)。
11?月 王志新当选为第三世界科学院院士。
11?月?诺贝尔奖获得者、美国科学家Harold?Varmus 来访?。
12?月“酶活性部位柔性”获国家自然科学奖二等奖。
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